数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，被分为银河帝国与自由行星同盟这两个拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。两国之间的抗争持续了150年，以无边无际的广袤银河为舞台，重复着无止境的战斗。银河帝国的门阀贵族社会的腐败，以及在自由行星同盟中被称为“民主主义的弊端”的群愚政治正侵蚀着两个国家。之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。“常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆，以及人称“不败的魔术师”的杨威利。两人率领着帝国军与同盟军，展开了不知道是第几次的冲突。
不是全部。然而，埃利亚斯，智世能够接受自己了。卡塔菲鲁斯睡了一会儿，致恢复日常生活的她到达的是魔术师的这是对互助组织“学院”的邀请。大英图书馆的地下室...与以往不同的魔法师社会。与“人”的相遇和互动打开一扇新门。这是一个拯救我（你）的故事。
通常特典
科技发达的机械化理想国度，帝国。驱使超自然力量·星灵术，作为“魔女之国”受人畏惧的涅比利斯皇厅。两国的漫长战争仍在持续。 帝国最强战力伊思卡和别名“冰祸魔女”的皇厅公主爱丽丝莉洁在激战中逐渐了解对方的真心，被对方的人生理念和理想所吸引，成为了劲敌。 二人在独立国家阿尔萨米拉粉碎了帝国和皇厅的阴谋，约定改日再见后，走上了各自的道路，却以意外的形式实现了约定。 伊思卡和爱丽丝的妹妹希丝蓓尔达成交易，作为她的护卫潜入了皇厅。爱丽丝为了寻找希丝蓓尔，来到了皇厅的都市里斯伯登。 偶然的重逢让二人的内心燃烧得更加激烈，然而与此同时，帝国的间谍“纯血种·受试体E”在皇厅内部暗中活跃，帝国的“特殊任务·女王捕获计划”即将启动。 伊思卡和爱丽丝的关系面临撕裂，他们究竟能否对抗这一命运。
炼金术，一种建立在等价交换原则基础上的科学，将物质进行理解、分解、再构造，将一种物品变成另外一种。但是，这样先进的技术却不能进行人体炼成，这是炼金术绝对的禁忌。可是，拥有极高炼金术天赋的爱德华（朴璐美 配音）和阿尔冯斯（钉宫理恵 配音）兄弟，因为对母亲极大的思念不惜触犯禁忌。而最终的代价却是，爱德华失去了一条手臂和一条腿，弟弟阿尔冯斯只能将灵魂依附在一副巨大的装甲之内。终于明白一切的兄弟俩，为了恢复原状，寻求更多的炼金术知识，成为国家炼金术师踏上了寻找终极炼金物品——贤者之石的旅程。在不断的探索中，两兄弟终于发现了贤者之石背后的真相，对身处的这个军事化国家也有了更深入的了解。此时，面对国家、民族、家庭……炼金术的未来究竟在何处。
