这部六集 OVA 系列改编自已故、备受喜爱的杰出漫画家石川健的奇幻科幻时代剧。这一年是元和元年。德川家康在 1618 年的夏之阵中击败了丰臣军。战败的将军真田幸村被德川的密探服部半藏斩首。然而，幸村只剩下头颅，转世为恶魔阿贾拉王。他召集手下真田十勇士来到江户城，残忍地屠杀了德川幕府的家臣。然而，在遥远的深山中，九龙氏（一群超能力者）的长老无幻大权察觉到现实世界发生了一些奇怪的事情。大权召唤了他的儿子弥勒，并将他的灵魂送入江户城。弥勒在那里“目睹”了真田魔族的残暴行径。大权和弥勒意识到，雪村的魔法力量背后隐藏着来自远古宇宙的“龙”的力量，并决心与之抗争。两人之间一场惊心动魄的战斗由此拉开帷幕。

中世纪，炼金术士们以巨大的代价从恶魔的手中得到了传说中的永生之酒，凡是喝下永生之酒的人们，正如它的名字那样，将会得到永远不会死亡的肉体。永生之酒带来了希望，却也引发了空前绝后的灾难，因为私欲和利益，与此酒相关的人士一个接着一个失去了踪迹。随着禁酒令的颁布，永生之酒的下落逐渐成为了谜题，然而数年过后，有关它重出江湖的消息再次被传得沸沸扬扬，在纽约的黑道中激起了涟漪。身怀绝技的少年洛菲（吉野裕行 配音）、不老不死的炼金术士阿洛瓦（宫本充 配音）、个性莽撞大大咧咧的夫妻艾萨克（小野坂昌也 配音）和哈文特（青木静香 配音），这些身份从无交集的人们，也为了追寻永生之酒的下落而走到了一起。

故事从一名高中生叙述而开始，五岛桐绘和她的男朋友斋藤秀一以及住在这个受诅咒的黑涡镇的人们，面对着一连串围绕在漩涡相关的诅咒和超自然事件当中，而这座小镇的秩序也即将失控。

年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。几年后，一位右臂与左腿都是由“机械铠甲”替代的国家炼金术士出现在人们的眼前，他被称作“钢之炼金术师”。 

布兰登和哈利是平民窟里混大的哥们儿，勾肩搭背成了无数小混混中的典型——心比天高，以为凭着年轻和不怕死可以把整个世界都踩在脚下。然而真正的上位者略动动小指，他们的世界已是天崩地裂。两人失去了一切有被逼入死地，当有了绝境逢生的机会，哈利迫不及待的加入了黑手党，他再也不要过落水狗一般的生活。布兰登只是犹豫了一下便跟定了他——他们已经习惯了是福是祸一起分担。布兰登深收黑帮老大Big Daddy的喜爱。成了组织的最强杀手。而哈利为了自由支配和给予权利，用尽手段不断往上爬，成为了组织的“背叛者”，成为了布兰登的清除对象……而布兰登下不了手，他的心还是当年那个黑发少年。可哈利不是了，他要先下手为强，他不能容忍任何阻挡自己往上爬的道路……<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 十几年后，一个迷一样的老人，一个另人恐惧的孤傲杀手，一个被组织追杀的少女！对于两手携...

“瞧一瞧看一看，暗芝居表演开始喽~”伴随着稀疏冷清的鼓声，江湖艺人（津田宽治 配音）鬼魅的吆喝声再度响起，充满好奇心的孩子从四面八方聚过来，一同观看哪一个有一个让人胆战心惊并且回味起来已经冷汗直冒的恐怖故事。承接第一季，《暗芝居》的故事继续以洋片（纸芝居）的表现形式讲述短小精悍的恐怖故事，而此次制作阵容得到壮大，在恐怖领域占有重要席位的清水崇（《咒怨》）、井口升（《无限富江》）等导演相继加盟，无疑提升了本作第二季的恐怖指数。片尾曲方面，初音带来的《四十九日目》，其邪典气息不逊于前作。此外，官网依然不定期提供恐怖短篇小说，让爱好者们继续在幽暗的世界里徜徉。

20世纪末，15岁的少年榊原恒一（阿部敦 配音）由于父亲前往海外公干的原因，于是来到亡母的家乡夜见山市，暂住阿姨三神怜子（宮牧美沙代 配音）家中等待转入新的学校。在此期间，他的旧病复发，入院治疗，某晚，恒一在空荡荡的走廊内邂逅一名穿着水手服、左眼戴着眼罩但阴气逼人的美少女，这似乎预示着一段不平凡生活的开始。病愈出院，恒一顺利转入夜见山北中学3年3班，同学们热情亲和，可是似乎对他隐藏着什么秘密，而且他也再次看见医院的那名眼罩女孩——同班同学见崎鸣（高森奈津美 配音）。当他尝试接近见崎时，殊不知自己已经无意间掣动了死亡的闸门……

雏见泽是一处坐落在群山环绕之间的僻静村庄，淳朴的民风使得这个古老的村庄一直以来都保留着祖先时代的祭祀习俗，称为绵流。昭和58年的一个夏天，这个村庄迎来了一个新的居民：少年前原圭一（保志总一朗 配音）。新的环境让圭一有些不太能适应，但在结识了温柔的龙宫礼奈（中原麻衣 配音），活泼的园崎魅音（雪野五月 配音），外表孱弱却内心坚强的北条沙都子（金井美香 配音）和古手梨花（田村由里香 配音）后，新的生活很快便如火如荼的展开了。随着时间的推移，一年一度的绵流祭奠即将开始，然而在此热闹之际，圭一却听闻了一些雏见泽不为人知的过去，以及历年来绵流祭奠所带来的，一人失踪一人死亡的被称为“神隐”的恐怖事件。这些传闻是虚是实？过往单纯快乐的生活是真是假？作为一名“外来者”，前原圭一出人意料的逐渐接近了某个重大事件的真相。

巽幸太郎（宫野真守 配音）表面看上去是一个平凡无奇的男子，实际上，他正在策划一个名为“僵尸乐园偶像”的诡异计划，他疯狂的复活了7个可爱的女孩子，让她们成为僵尸偶像，展开了一系列的活动。