故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了，小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了!在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
故事背景为架空世界“碧岛”，这座位于日本列岛西南方的岛屿，被财团改造成宏大华丽的白金牢笼。本作主人公是濑良垣苍叶（私市淳 配音），在旧住民区一家“平凡”商店里打工，犬型智能伴侣“莲”常伴其左右，好友红雀（高桥广树 配音）亦对其照顾有加。然而从以前开始，苍叶就一直忍受着原因不明的头痛。同时，岛内又开始流行起一种虚拟对战游戏——“莱姆”。一向对此毫无兴趣的苍叶，某天在送货路上，突然被一名神秘人物拉入了莱姆的异空间内，强制进行对战。头痛的日渐加剧，背负着的沉重过去；神秘人物连番登场，都市传说“神隐”再现，苍叶看似平静的生活，正悄然发生了变化。
心爱在木造房屋小镇度过的第二个夏天即将结束，季节即将变成各种盛大活动满载的秋季。不论是在学校还是在Rabbit House，都有很多开心的事情！心爱、智乃以及大家都难以抑制对未来的期待……！
作品主角是不太会拿捏与他人之间距离、身材娇小的阿波连同学，以及目标是「交到一百个朋友」、坐在阿波连同学邻座的来堂同学。两人之间的距离以掉在地上的橡皮擦为契机而急速接近，一场青春恋爱喜剧便由此开始。
