丹药过期怎么办？不怕！我能回溯丹药时间，你们过期的丹药我全都要！修炼功法太慢怎么办？不怕！我能将修炼功法的时间往后调上五年，功法立即是大成！身体受伤了怎么办？不怕！我能回溯身子的状态，让你的身子恢复受伤之前的样子。回到异世界发现自己是个废材？不怕！我可以修改万物时间线！
在午夜神秘的钢琴声中凹凸学园的新学期开学了。教师团队对校园中发生的神秘事件含糊其辞，而一个个谜题却总出现在同学们的身边。洒满阳光的美术教室弥漫着浓雾、破旧的老教学楼散发着诱人的香气……幕后主使竟拥有关闭校园的权利！同学们，凹凸学园解谜大事件欢迎加入！
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
天蓬元帅遭雷部天尊诬陷，被贬凡间封印三百年，意外与高老庄少爷朱八戒神凡共生！一人一仙共用身体，爆笑又热血，结识锦毛鼠、貔貅金多米和牛魔王夫妇，卷入伪灵蕴石阴谋。为洗冤仇，对抗雷部追兵，护送金蝉子转世唐僧西行，最终能否破局、还三界清明？
