过着平凡人生的平凡上班族，某天准备出门上班时心脏病发，醒来时已经成为异世界某个弱小贵族家的嫡子「亚尔斯」。到了这个世界，亚尔斯还是一样平凡，只是多了能将别人的能力化为数值的「鉴定」能力。得知自己的国家转眼就要爆发战乱后，亚尔斯为了生存并且保护领地与领民，决定用「鉴定」能力四处网罗优秀人才，从无到有打造超强领地！
古罗沙被初期化后，以为回复和平的网络世界突然受到名为巴古病毒的入侵。中学生春日结再次被安排进入网络世界变身成守护星阿结；另外不知道从何处来名为“守护星阿爱”的人登场，她的目的是要找一个名为阿爱的小女孩，而这个小女孩阿爱正好又跟巴古病毒连上关系……
在东京晴空塔底下，世界一流的武术爱好者德川光成设置了一个研究实验室，进行禁忌实验。实验使用最先进的科学技术，目标是用传奇剑豪宫本武藏的遗骸创造出克隆人，让他在现世复活。这位强大战士早已赢得所有想像得到的称号与荣誉：究极武士、剑圣、天下无双。如今，他的重生恐怕将撼动现代日本，甚至全世界都会陷入混乱。准备好见证超越历史的终极大战，刃牙、勇次郎、地下斗技场的高手们，以及所有为战斗而生的人都将卷入其中。
故事发生在信息技术科技已经极为发达的未来，彼时，人类对于电脑和人工智能的依赖已经达到了顶峰，可是这么说，人工智能虽然服务于人类，但同时也掌控着人类生活的方方面面。巨型主机古罗沙是电脑网络的主管，在自我进化之中因为嫉妒的情绪而产生了控制人类的思想，导致整个网络系统都受到了影响。为了限制古罗沙的行动，他的开发者犬养博士制造了八个守护星软件。春日本是一名平凡的女孩，在机缘巧合之下结识了其中一个软件IR，在IR的引导之下，春日进入了虚拟的网络世界，成为了守护星阿结，她的任务是要将散落各处的守护星软件集结在一起。
1996年，人类的探索之旅延伸至地球之外的火星，但美苏冷战的战火也蔓延到了火星。同年10月3日，一群被选入联合国赞助的宇宙文化社（太空体验班）的青少年抵达火星，却突然遭到名为SPT的神秘移动武器的袭击。驾驶着蓝色SPT的少年阿尔巴特罗斯·纳尔·阿格·阿苏卡挺身而出，将他们从困境中解救出来。他透露，地球正遭受格拉多斯星球的威胁，而他自己则是半地球人半格拉多斯人的混血儿。宇宙文化社的青少年们起初对阿格抱有怀疑，但在战斗中，他们的友谊逐渐加深。为了共同返回地球，他们逃离了火星，踏上了艰辛的旅程。
