继续讲述一个4岁男孩Kai和他的两个爸爸Damian和Jerry的故事，第二季从一个意想不到的客人Jimmy开始，他是Damian和他前妻的孩子。吉米的出现给达米安和杰瑞的生活带来了动荡。达米安仍然和他的前任保持联系，并且非常照顾吉米。这开始让杰里嫉妒，担心达米安可能会爱上一个女人又来了。与此同时，他面临着来自母亲的压力，希望他有自己的亲生孩子。另一方面，达米安在照顾吉米和杰瑞之间挣扎。他们如何解决所有的困难，维持他们的关系和家庭？
柯震宇（李国毅 饰）是一名经验非常丰富的律师，在他巧舌如簧的辩论之下，很多委托人都得以洗清了身上的罪名。因为在业界备受推崇，柯震宇的性格变得非常的冷酷和高傲，无形之中得罪了很多人。终于，在一场审判中，柯震宇被检察官慕思明（谢坤达 饰）起诉伪造证据，最终，罪名成立的柯震宇被永远驱逐出了律师界。
单元个案：惩教署发现监狱内有犯人不断收到违禁物品，高层怀疑有职员协助非法偷运。负责的调查员是陈锦鸿饰，亲自到惩教署深入调查，熟识内部运作方便找出犯人。他锁定其中一名犯人黄德斌，因他与女友袁彩云感情佳，入狱后又得到违禁品。最后揪出一名因欠下赌债的二级惩教助理阮兆祥，并当场在其身上搜获违禁品，并将涉案人等一网打尽。真实个案：2001年，台北监狱受刑人勾结管理员在狱中贩毒被发现，一名吴姓受刑人涉嫌行贿狱政人员，利用手机，遥控外面的伙伴进行毒品交易。
该剧以单元形式展开讲述女法医“JD宋安妍”（蔡卓妍 饰）在“死因解码研究所”的遭遇为线索，协助警方破获一个个诡异案件，同时试图探寻父亲旧案的真相，并与神秘女子林小美（钟欣潼 饰）、热血探员刘志明（张孝全 饰）之间展开的一系列惊心动魄的故事。女主角“JD宋安妍”因患HSP“高敏症”而拥有极高敏感度的大脑，不由自主全天候接收一切资讯，在不堪其扰的同时也屡次凭借信息储备量非凡的“最强大脑”打开线索关窍，解开悬案谜题。
镜文学作家林峰毅同名原著改编。讲述一群热血年轻人步步卷入社会事件，在前途迷惘、追求梦想之中蜕变坚强的自我。
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富强（陈锦鸿 饰）是一名保险经理人，某日，工作的原因令他遇见了名为谷若晞（吴美珩 饰）的银行职员，两人新仇旧恨一起算，闹得很不愉快。没过多久，谷若晞竟然调到了富强所在的公司，两人成为了同事，再加上富强不成器的弟弟富勤（马国明 饰）喜欢上了谷若晞的表妹伍美琪（江芷妮 饰），使得这一对冤家之间的关系犹如水火。行业内的不景气让富强和谷若晞同时想到了“爱情保险”这一别出心裁的主意。
仁和医院高级精神科医生高立仁（方中信 饰）在婚礼前痛失为重案组探员的未婚妻莫敏儿（徐子珊 饰），随即陷入悲伤中不可自拔，甚至为此辞去工作。却不料就在此时，医院接收了一名声称被幻听所困更涉嫌强奸案的精神分裂患者。对此案不甚关心的高立仁路过案发现场，误打误撞帮助了博安医院法医精神科医生梁启荣（萧正楠 饰），并建立亦师亦友的关系。已经在外挂牌行医的连志森（蒋志光 饰）担心老友丧妻后萎靡不振的精神状态，多番劝说他重振旗鼓。高立仁也终于决定去博安医院任职。
故事发生在明朝末年，胡、苗、范、田四家人本是至交，却因为一场误会而结下了血海深仇，其后人们更是为了争夺明室遗留下来的宝藏而大打出手死伤无数。胡一刀（吕良伟 饰）侠肝义胆想要使沉冤得雪消除误会，却遭到了田归农（曾江 饰）的陷害最终命丧苗人凤（谢贤 饰）手下。
冷静理智的法政部高级化验师高彦博（欧阳震华 饰），洞察力过人的他单凭一条头发、衣物纤维便能协助警方破案。但他没有想到的是，妻子的弟弟、身为法医的古泽琛（林文龙 饰）和高级督察梁小柔（蒙嘉慧 饰），都怀疑彦博毒害了自己的妻子。
警察担任黯夜守护者，守护着这个城市，亦透过不同案件，揭示案中人背后的故事，探索社会阴暗一面。除了案中受害者，陈展鹏、陈炜、陈敏之等所演的角色也是有故事的人，以往的遭遇影响着生活，每个选择亦影响将来的人生。面对人生种种纠结与关系上的爱恨交缠，该如何作出正确抉择，寻找人生出路？
