《假面骑士Kuuga》完结后EPISODE1－2再编集版，对部分镜头重新整理，并增加TV版时没有的片段，同时配乐、配音和电脑特效的部分进行了新的制作，而且提升了画质。
在寻找他的妹妹，一个叛变的罪犯寻求答案在一个肮脏的酒店，他遇到了一个阴险的客人和浪漫的神秘的女服务员。
公元2085年，全球管理力量举办了一次武术比赛。最后一个站着的战士赢得了一个信仰的绝对统治权。
京平是日本一个名为“SEEK”的秘密非政府间谍组织的刺客，他的女友在一场悲惨的空难中丧生，他正沉浸在失去爱人的悲痛之中。此时，“SEEK”的领导人三云亮联系他，委托他执行一项紧急任务：营救一名同事，找回一种名为“RDX@”的新型高爆炸性液体，并阻止残暴的黑道头目小月惣治郎及其团伙控制日本。虽然人们一度认为忍者已经消失……但新一代的刺客依然存在，他们守护着日本和一切正义；忍者即将回归。
一名警方特勤人员韩啸在一个涉黑集团做卧底，集团元老斩崩刀绑架富二代招来特警队围剿，以斩崩刀为首的劫匪皆被击毙。韩啸死里逃生引起魏哥怀疑，魏哥将韩啸抓来进行严刑拷问，韩啸发挥影帝演技和聪明才智与魏哥博弈，努力洗掉嫌疑，获得魏哥信任，继续卧底涉黑集团……
穆鑫(矮人国王养子)为救部落与人质阿青，寻中古之剑。途中救美晨，其父巫风牺牲解封其白巫术。众人夺剑时，巫隐(美晨养父)化魔剑欲统治，哈吉牺牲之血破魔。阿青为阻蛮王巨天得剑自尽，真爱之血解剑封印。穆鑫终封印巨天，归矮人国为王。
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水师提督顾长风（于荣光饰）奉朝廷之命带领西班牙舰队探访黑木崖，过程中西班牙领队欲打开东方不败的棺木与视东方不败为偶像的顾长风发生争执。正在此时黑木崖上忽然现身一怪人（刘洵饰），可以以掌接西班牙火枪子弹。顾长风被怪人所救，却身受内伤，坚信其便是东方不败，坚持要一见其真面目 ，虽死无憾。怪人一偿所愿，让其看自己的庐山真面目，正是当年风采依旧的东方不败（林青霞饰）。顾长风告诉东方不败江湖上有很多人正在冒充他的名号为非作歹，东方不败于是决定留其性命，让他看着自己重出江湖。与此同时，东方不败旧时爱妾雪千寻（王祖贤饰）正率领着一群苗人打着东方不败的旗号与日本倭寇就海域问题谈判，雪千寻痴心不改，重组神教只是为了等待爱人归来......
