美军为了反恐研制出一种“真理”病毒，能够让人说真话。但是病毒注入后48小时开始发生变异，感染者无一生还，一场“大传染”正蔓延开来。这时，一位教授带领学生误入病毒感染区，一场无声战役正在打响……
第一集中，变异人在X教授的指挥下，将邪恶的万磁王打入冷宫，但是依然得不到社会的承认。在一次政治要人遭到暗杀后，所有的矛头又一次指向变异人。这一次，X教授也感到压力大增，以致于跟美国总统都要就此事进行磋商。一个拥有很高声誉的前将军，率领着反对变异人的联盟连续对x教授施压。万磁王在这种情况下，不得不寻找与X教授联手抵抗前将军的方式。金钢狼的身世也将在本集中进一步揭开。
故事重返上世纪90年代，终极反派宇宙大帝（科尔曼·多明戈 Colman Domingo 配音）从天而降，驱使以天灾（彼特·丁拉基 Peter Dinklage 配音）为首的恐惧兽掀起地球危机。绝境之中，蛰伏许久的巨无霸终觉醒，联合汽车人变形出发，一场前所未有的决战即将上演。
娜塔莉的男友遇害后，她制造了一台机器，通过改变自己的记忆来改变过去。一名联邦调查局特工、娜塔莉的姐姐和心理医生都试图阻止她自残，但毫无效果。她愿意不惜一切代价，让他回来。
年轻漂亮的凯拉得了一种奇怪的疾病，她的皮肤开始老化，干裂和瓦解。当她发现她可以用别人的皮肤来替代自己的皮肤时，她必须做出选择，看着自己的躯体枯萎死亡，还是屈服于诱惑，不管代价如何。
两个陌生的年轻人发现了一艘神秘的宇宙飞船，它将他们带回到数百万年前。
末日世界，地球一片荒芜。杀手雷霆叛变了自己所在的邪恶组织“天狼舟”，决定为正义而战。他救下为给老大苍穹换心脏的少女小洁等四人逃离天狼舟。苍穹派出力霸、铁刹军团来到沙漠中一所废弃的钢铁城追杀雷霆，一场猎杀大战就此展开。
一觉醒来，他被剥夺了所有财产，困在一个光秃秃的房间里。在一台原始电脑的帮助下，他必须学会在与世隔绝的新生活中生存下去，在这里，娱乐是唯一的货币。
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马戏团主任艾蒙多（里卡多·蒙特尔班 Ricardo Montalban 饰）收留并保护了一只孤苦无依的猩猩，取名凯撒（罗迪·麦克道尔 Roddy McDowall 饰）。在艾蒙多无微不至的关怀下，凯撒渐渐长大，它和“父亲”艾蒙多之间的关系十分亲密。一场病毒的肆虐让猫和狗在地球上绝迹了，失去了最忠诚的朋友们，需要动物们陪伴的人类将目光转向了和他们极为相像的猩猩，就这样，饲养猩猩当做宠物成为了新的时尚。然而，人类的残暴本性使得这些原本温顺善良的猩猩们生活苦不堪言，它们被折磨虐待，永远的失去了自由。终于，猩猩们决定不再忍耐，在凯撒的带领下，它们英勇起义，发誓定要推翻人类的压迫和统治。
